Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms