Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms