Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL6Q6ICC9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL6Q6ICC9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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