Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIRMAQ69YN4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VIRMAQ69YN4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms