Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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TNS3Q68CZ2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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