Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM69BQ5VUD6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms