Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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