Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKDCCQ504Y2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms