Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms