Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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