Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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