Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTF1Q16619 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTF1Q16619 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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