Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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