Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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