Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms