Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms