Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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