Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms