Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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