Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHPRHQ149N8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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