Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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SMCO1Q147U7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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