Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms