Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAPSNQ13702 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms