Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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