Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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HTR4Q13639 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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