Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms