Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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