Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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