Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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LSAMPQ13449 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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LSAMPQ13449 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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