Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MKRN4PQ13434 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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