Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms