Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms