Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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