Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANK3Q12955 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms