Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.4 ms