Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms