Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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