Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1AQ12756 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms