Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ST3GAL4Q11206 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms