Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms