Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms