Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXM1Q08050 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms