Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms