Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms