Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms