Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms