Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms