Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARDQ03181 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms