Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREMQ03060 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREMQ03060 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREMQ03060 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREMQ03060 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREMQ03060 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREMQ03060 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREMQ03060 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms