Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms